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Primero es necesario habilitar la opción para prender la computadora con un magic packet en el Bios. En un mainboard Asus es necesario entrar a Advanced View y buscar Wake Up Options > APM > Enable Power On by PCIE.

Luego usar el siguiente comando (remplazando eth0 por el id de la tarjeta Ethernet):

sudo ethtool -s eth0 wol g

Luego para prender la computadora hay que usar el siguiente comando (remplazando 00:00:00:00:00:00 por el MAC address de la tarjeta ethernet):

wakeonlan 00:00:00:00:00:00

Si se desea que esto sea permanente se puede crear un servicio en systemd creando un archivo en /etc/systemd/system/wol.service con el siguiente contenido

[Unit]
Description=Wake-on-LAN for eth0
Requires=network.target
After=network.target

[Service]
ExecStart=/usr/bin/ethtool -s eth0 wol g
Type=oneshot

[Install]
WantedBy=multi-user.target

despues para activar el nuevo servicio se utiliza el siguiente comando

systemctl enable wol.service